Останавливаем сервис MySQL:

# /usr/local/etc/rc.d/mysql-server stop

Запускаем MySQL командой:

# mysqld_safe --skip-grant-tables

Переводим в фоновый режим:

# bg

Заходим в MySQL без пароля:

# mysql

Меняем пароль:

mysql>UPDATE user SET Password=PASSWORD('newpass') WHERE User='root';
FLUSH PRIVILEGES;
quit

“Убиваем” процесс MySQL:

# kill %1

И запускаем MySQL заново:

# /usr/local/etc/rc.d/mysql-server start

Взято отсюда